沉睡万年的辰南从神魔陵园醒来，在经历了一系列奇遇后名动四方。随着辰南来到央锦国遇到晨曦，新的冒险再次开启，在开元城大战、到死亡绝地寻找身世之谜、大战凌家只为求一个公正清明。在这一季，辰南会在探寻身世之谜的冒险当中不断搜寻雨馨的踪迹。
小师爷真名施野，出身于一个师爷家庭，其父为绍兴县府里一名堂堂的师爷。成为为国为民的大师爷不仅是小师爷自己的远大理想，也是其父对他的殷切希望，但小师爷却给这个理想取了一个更酷的名字——智慧快乐侠。他性格顽皮，举止搞笑，关键时刻却能区分大是大非，嫉恶如仇，极富侠气正义感。他借用自己的智慧和勇气，和小伙伴们一起，克服各种困难，帮助他人，维护了正义和公理。本片突出智力元素，结合师爷文化与传统文化中的侠义仁勇精神，把小师爷打造成智慧、侠义的代表和象征。同时，本片的素材多取自绍兴文化，体现了乌篷船、乌毡帽、黄酒、沈园等典型的绍兴特色元素，力图全面展现绍兴地域特色和文化风貌。
远在北欧大海中央的博克岛，即将迎来一年一度的快乐圣诞节。希卡普（杰伊·巴鲁切尔JayBaruchel配音）和他的好朋友无牙一如既往，在博克岛的上空自由翱翔。可是，突然天空布满了各种各样的龙，甚至连岛上的龙也振翅高飞随这群龙远去。岛民们非常失落，但也只能面对龙离去的事实。未过多久，连无牙也在某个机缘下振翅高飞。过了数日，无牙始终没有返回，这令希卡普非常失落。某天，他被夺门而出的胖龙Meatlug撞到空中，继而随着它来到了一片陌生的小岛。在那里，希卡普发现了所有失踪的龙，也明白了他们离开博克岛的原因……而他的好朋友无牙究竟又在哪里呢？
日本承办的全球最大体育盛事WSG即将在东京举办开幕式。 为此，融合日本先进技术打造最高时速1000km的「真空超电导磁悬浮」即将通车。往返于新名古屋站至东京新开的芝浜站。 在这个万众瞩目的关头，汇集知名赞助商的酒会现场遇到了突发事件。 知名企业的高官接连遭到绑架。事件背后，是全程监视的赤井秀一，以及等候赤井发令的FBI探员们的身影。 根据柯南的推理，本次事件也许与15年前美国波士顿发生的WSG绑架事件有关，当时也是由FBI管辖。 这真的是偶然吗？在各国游客聚集的日本到底会遇到什么样的事件？ “贯穿日本的子弹”超真空电导磁悬浮启动之时，“危险一家人”终于集结！
今年森林村又将迎接一年一度的星星庆典，大家都迫不及待，唯独可可兔女孩芙蕾雅在伤脑筋。庆典当天是妈妈的生日，但她却想不到该送妈妈什么礼物。此外，芙蕾雅还被赋予重责大任，负责挑选“今年的树”这个重要的活动...
故事发生在大名鼎鼎的绫薙学园之中，这里是孕育音乐艺能界新星的温床。在所有学科之中，“音乐学科”位居金字塔的上层，而由三年级顶级生所组成的“华樱会”更是学生们可望不可及的神圣存在，传说，被华樱会的首领凤树（诹访部顺一 配音）所选中的人，将会接收他的“特别指导”，送往无可估量的前途。 初来乍到的新人星谷悠太（花江夏树 配音）、容易害羞怯场的那雪透（小野贤章 配音）、资质优异却容易冲动的月皇海斗（朗斯贝里·亚瑟 配音）、沉默寡言容易被人误解的天花寺翔（细谷佳正 配音）、心地善良外冷内热的空闲愁（前野智昭 配音），他们虽然拥有着无限的潜力，却因为各自的种种而成为了落选者，凤树的出现改变了他们的命运。
