Tomoya Mikami's life changed one day when his girlfriend Ayaka was hit by a car and killed on her way to meet Tomoya. He blamed himself for her death and never was the same after the accident. He began acting callously towards Yue and his other friends. Furthermore, every time Tomoya gets involved with a new girl, he sees images of Ayaka in his dreams. He decides he needs to find a way to say goodbye to his lost love once and for all, while dealing with several side romances at the same time.

　　就读于贵族名校——都会学院的少女藤之宫千岁（宫千岁）高傲蛮横，但在父亲过世后，藤之宫家的企业也随之破产，财产流失殆尽，留给千岁的只有一条会飞的粉红金鱼金比（小豆豆）。此后她被迫离开都会学院，来到一所即将拆除的乡下学校就读。
　　转校当天，千岁发现家族律师田中山（田大山）扣起了父亲数百万的财产，于是灰姑娘陡然暴富。但她恨透了都会学院学生会长由莉香（管萍香）的嘴脸，遂决定重见这所乡村中学。在此期间，她结识了华美子（娃娃）、葵彦（夏天葵）、秀一（林秀山）、不良牛歪歪等一班奇奇怪怪却心地善良的好朋友，他们之间发生了无数有趣的事情……

　　晴朗时节，江户川柯南（高山南 配音）和毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海（柴咲幸 配音）。谁知快乐的氛围很快被恐慌所替代，战舰上突然发现一条断掉的手臂，消失的自卫队员又引起军方的恐慌与猜测。原来某国神秘间谍X已悄悄登上宙斯盾，伺机盗取战舰上的绝密情报。
　　为了找出隐藏的对手，柯南和灰原哀（林原惠美 配音）、阿笠博士（绪方贤一 配音）、服部平次（堀川亮 配音）以及远山和叶（宫村优子 配音）通力合作，与间谍展开连番斗智斗勇的较量……

　　わたし、知りたかったの。
　　恋とはどんなものかしらって。
　　たがいに助け合う“互恵関係”を解消した、高校二年の小鳩くんと小佐内さん。
　　小佐内さんは、新聞部一年の瓜野くんとつきあいはじめる。瓜野くんは在学した証しを残し、小佐内さんにいいところを見せるため、市内で起きた放火事件を学内新聞で取り上げようと奮闘する。
　　一方、小鳩くんはクラスメイトの仲丸さんとつきあいはじめる。平穏な日々を過ごすなか、河川敷で放火現場に遭遇し……。小鳩くんと小佐内さんの小市民としての再出発は、はたしてどうなるのだろうか。

　　在那座歌剧院发生了第三起杀人事件！即将被拆迁的歌剧院中，一群有缘人被招待观赏最后的公演，同样被招待的金田一一、七濑美雪、剑持警部三人也再次被卷入其中。『今晚，歌剧院最后之夜，将上演两具尸体所点缀的华丽最终章』，魅影发出了如此危言耸听的预告信……
　　在去温泉途中迷路的金田一一、七濑美雪、剑持警部三人，来到了废墟之村——舞兰村。这个村庄发生了遗留的吸血鬼传说引起的谜样杀人事件。吸血鬼的魔爪追逐美雪而来，阿一能够解决这起案件吗？

　　因为所在的波路中学倒闭，新学期一开始，先岛光（花江夏树 配音）和青梅竹马向井户爱花（花泽香菜 配音）以及好友比良平千咲（茅野爱衣 配音）、伊佐木要（逢坂良太 配音）转校至位于陆地的美滨中学继续学业。先岛和朋友们是生活在海底的海之民，传说很久以前人类全部始于大海，大有一部分人迷恋陆地的生活，而放弃了神赐予的“胞衣”。千百年来，陆之民和海之民在摩擦中共存，他们之间有矛盾，有误会，也有憧憬和向往。在新的学校，先岛和爱花结识了生活在海边的少年木原纺（石川界人 饰）。
　　来自不同的种族，少男少女别样的青春故事就此上演……

剧情接《倾物语》，在与忍野忍结束时间跳跃后回到当代的阿良良木历，向八九寺真宵归还遗落在阿良良木家的背包后，在路上却遭到不明物「暗（くらやみ）」的袭击。危机之际，被斧乃木余切搭救。在「叡考塾」废墟中，小忍向历讲述了自己400年前在日本与第一任眷属的相遇和遭到「暗」的袭击的经过。
再次遭到「暗」袭击的历与小忍失去了联系，最后在神秘的卧烟伊豆湖的帮助下得知了「暗」的正体是追杀偏离了怪异之道的怪异的非存在，而追杀的目标不是小忍而是八九寺真宵。
由于母亲节时得到阿良良木历的帮助，真宵回到了自己的家，而此刻的真宵已经成佛，但是真宵却迟迟不去那个世界报到，依然留在这个小镇。让人迷路的怪异「迷牛」却不再让人迷路，真宵已经偏离了怪异之道，因此，「暗」出现了，要将八九寺以及目击到八九寺的人类全部吞噬。最后，为保全大家，真宵含笑成佛。

公园的滑梯前，传来了儿童略显孤独诡异的童谣，阴森可怖的《暗芝居》再度上演。进入空无一人浴池内洗澡的青年，遭遇隔壁浴室不断借各种物件的女人；两个迷路的人夜晚开车，在藏着可怕生物的隧道内抛锚；情侣搬到便宜的公寓，这里却有讨厌的老鼠；某病人半夜惊醒，他发现医院内有一处格外热闹的病房；诡异的标本博物馆，有着另人意想不到的藏品；热闹的庙会上，两个女孩不小心进入一个诡异的庙会现场；三个集训的男孩挑灯夜聊，其中一人讲起了他最近的噩梦；年轻人潜入鬼宅探险，见到了苍白的女儿节玩偶；一所中学内，流传着会把人捏碎的握手大叔的传说。恐怖的故事接二连三，请一定坐稳，不要走开……