莉丝妲黛（丰崎爱生 配音）是刚刚上任没多久的新手女神，可这样的她要面临的，是难度为S级别的拯救世界的任务。为此，莉丝妲黛召唤出了名为龙宫院圣哉（梅原裕一郎 配音）的勇者，让莉丝妲黛松了一口气的是，圣哉丛数值上来看属于那种超强的勇者，可很快，他就暴露了他唯一，但也是致命的弱点——过于慎重的个性。 必须同时准备至少三套装备以备不时之需；把自己关在房间里练肌肉练到满级也不愿意出来；即便对手是史莱姆也要使出全力攻击，渐渐地，莉丝妲黛开始怀疑，这个看上去很靠谱的男人，是不是头脑有点问题？
东京都高度培养高中，以百分之百的升学率和就业率为自豪，是一个梦幻般的学校，每月发放相当于10万日元的金钱点数。然而，其实际情况是一所实力至上主义的学校，只有少数成绩优秀者才能享受优厚待遇。进入第三学期，从D班晋升到C班的绫小路们前往林间学校。在那里，进行的是被称为“混合合宿”的全年级联合进行的特别考试。正如其名，男女分开，必须组成几个混合多个班级的小组，并以小组为单位进行评分的考试。迄今为止与其他班级的学生作为敌人争斗的他们，必须与他们合作才能获得高分，而且最重要的是，不能达到边缘线的小组将有人退学，这一规定让所有人都感到不安。激动人心的第三学期引起了波澜，现在正式拉开帷幕！
故事发生在位于东京都的音乃木坂学院中，经济不景气，人口老龄化等等的社会问题让这所学校的招生成为了难题。找不到学生，学校只能关门大吉，就在这时，九名少女站了出来。这些对学校感情极深的少女们决定，要为了保护学校不被废校而做出努力。 活泼健气的高坂穗乃果（新田惠海 配音），温文尔雅的园田海未（三森铃子 配音），温柔勇敢的南小鸟（内田彩 配音），聪明伶俐的混血儿绚濑绘里（南条爱乃 配音），我行我素的学生会长东条希（楠田亚衣奈 配音），傲娇大小姐西木野真姬 （堀絵梨子 配音），运动系少女星空凛（饭田里穂 配音），默默无闻的小泉花阳（久保由利香 配音），OTAKU宅女矢泽妮可（德井青空 配音），这些勇敢的少女组成了偶像团体，发誓要为了保护学校不被废校而做出绝对的努力。
正值情窦初开之时的公主，以为自己的心上人是付望舒，却可惜无缘亦无份。而另一边，九皇叔和她虽以叔侄相称却并无血缘关系。皇叔对于她来说，亦师亦友，且两人年龄相差无几，可谓青梅竹马，两小无猜。可孟玉珥一开始却没意识到九皇叔的一往情深，爱他念他也不自知，毕竟辈分不对。
日本幕末时期，在江户长大的少女雪村千鹤出生在一个比较罕见的西医家庭，由于上京工作的父亲已经很久没有联系家里，千鹤怀着对父亲的担心而孤身来到京都，然而她在这里见到的却是正在与嗜血怪物作战的新选组队员们，由于目击到了新选组不为人知的秘密行动，千鹤暂时被软禁起来，从此与新选组结下奇妙的缘份。然而在继续寻找父亲的途中，千鹤遇到了神秘刺客的袭击，当她得知了秘密的全部与自己的身世之后，才发现自己的命运与新选组已经紧紧的联系在一起。（动画版的人物设定可谓美形到了极致，收到众多女粉丝追捧！）
