故事是在曹院长倾其所有创建的“美好时光”养老院展开的，几位老人都因为各种原因在自己的生活境遇中各有不同的烦恼与矛盾，但不约而同地都选择了到养老院寻找自己理想的生活。在他们身上发生了一连串啼笑皆非的幽默故事之后，他们都恢复到了以前幸福美满的生活中。
燕璃国，大将军府的柳静姝和柳嘉是一对双胞胎姐妹。当时，双生子被视为不祥之兆，妹妹柳嘉便从小隐藏身份，以二狗的名字被柳大将军偷偷养在府中。长大后的两人虽长相如出一辙，但性格截然不同，姐姐温柔大方，妹妹却活泼调皮，且经常冒充姐姐的身份溜出府邸，玩闹惹事。二姐妹十五岁时，在将军府和宣平侯府联姻的订婚宴会上，萧任衍因不愿轻易接受被安排的婚姻，还未入席就找理由离开，没想到好遇到来厨房偷东西吃的柳嘉。二人误打误撞，落入水中，在水下却不小心吻在了一起。柳嘉真面目被看到，萧任衍却对柳嘉动了心。柳将军经过反思，觉得柳嘉一直被藏着也对她不公平，便在战争开始后，把她带到边疆抚养。 三年后，在边疆长大的柳嘉洒脱恣意，武艺高强，但也善良直爽……
于老乐（刘佩琦饰）说服儿子住进了幸福里养老公寓，跟好朋友重新成立了他们年轻时候组建的乐队，乐队不仅给养老院里的老人们带来欢乐，也为他们老有所为找到了途径。在养老院跟老人们的相处中，于老乐给幸福里的老人们带来快乐的同时也帮他们解决了不少麻烦。于老乐他们不仅实现了老有所乐、老有所为，同时也做到了老有所爱。于老乐找到自己的初恋情人白如雪，并跟白如雪圆满的举行了他们年轻时候就梦寐以求的婚礼。本剧在写老年生活的同时，表达了衰老的本质只是人机体的老化，而不是精神上的衰败，人到老年，只要精神不衰，年龄永远不是障碍。
1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。 由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
