故事发生在西汉初年，成就一世功业的汉高祖刘邦驾崩，虽然生前平定了韩信、彭越、英布等开国功臣的叛乱，却无法阻止皇后吕雉（刘雪华 饰）的专权。在这个强势女人的阴影下，刘氏宗族惨遭屠戮，锦衣卫首领刘宣（赵文卓 饰）被迫充当吕氏鹰犬，对同族亲眷痛下杀手。他和兄长刘湘（孙岩 饰）共同喜欢吕后的侄女琴子（高圆圆 饰），这段复杂的感情无疑成为兄弟俩矛盾的根源。偶然机缘，刘宣结识了名医淳于意那个调皮顽劣却纯真可爱的女儿缇萦（贾静雯 饰），故事又朝着未知的方向发展。 乱世初定，汹涌的权力斗争中，爱恋的男女随波逐流……
驿站附近的乐活山庄，暗中收集情报。女掌柜田津津聪明机警，乐于助人，跑堂田大壮武功高强，琴师朴岛毅见多识广。账房田大娘眼力佳记性好。四人各有秘密，却凑到一起。意气风发的福将军因得罪权贵，被贬中枢驿站。但实际上是来中枢城查一件要案。二人日久生情之际，边关急信丢失，送信差役惨死，彻底搅动了城中风云
邪派魔头宣慈一心想夺取天师府的至宝，率领手下进攻天师府，导致张天师受伤后逃离。宣慈派出三大杀手追击张天师。林楚燕是地方官林浩然的独生女，她从奶妈胡大婶那里学得一些小法术，能够在酒后施展阴阳眼，察觉到鬼魅的存在。林浩然是文官，而司徒镇业则是武官，两人相互勾结以敛财，为了避免猜忌，他们决定撮合他们的子女成婚。林楚燕对司徒文武有着深厚的感情，两人最终结为夫妻。然而，命运捉弄人，他们的成婚之夜楚燕因误饮交杯酒，看见了不应该看到的事物，导致误伤了婆婆，最终被休去妻子的地位。 尽管楚燕私下暗恋丈夫，她尽管生性高傲，内心却充满不甘，仍然不顾万里艰辛，寻找文武，希望能够挽回他的心。张天师发现司徒文武是七星脚，是修道的奇才，便收他为徒。张天师了解到楚燕的心思，决定帮助他们重新走到一起。在一个小镇上，文武遇见了戏班花旦凝凤，对她一见倾心。然而，戏班中的文生金玉棠也对凝凤展开了追求，却无意中发现她实际上是魔教的杀手人凤，并最终被杀害灭口。人凤对文武动了真情，但却因宣慈的命令要杀死文武，幸好张天师和楚燕及时赶到，最终人凤被张天师所杀。尽管遭遇重重困难，文武依然执迷不悟，愤然离去。
1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
该剧讲述一个诈欺师一不留神和警察结婚，随后被卷入荒唐的事件并成为国会议员候选人的故事。
