第三季的故事从“高第街工业品市场”铭牌挂上高第街牌坊开始，街坊们有的早餐店越做越火，有的从事服装生意，有的专卖进口产品，有的开音乐茶室，有的组建乐队，有的赴港探亲……在充满激情的年代，高第街街坊们跟着时代的步伐，每个人都找到自己的新生活。
女记者欧阳兰和未婚夫坂野正南结婚在即，突然接到任务，帮助归国华侨寻找六十年前在太行山参加八路的女战士思源。当年在太行山参加过战争的随军老记者穆易告诉欧阳兰，思源很像当年在太行山做随军记者时见过的一个叫培蕊的女兵。于是，一段围绕着培蕊和跟她有关的故事在欧阳兰的追踪下，一点点清晰起来：培蕊和李营长之间的爱情、铜家峡惨案、花儿、黑妹子……无数个感人至深的故事让欧阳兰的内心不断翻腾。然而，一只“绣袜”却让欧阳兰震惊的发现，坂野正男的父亲正是当年制造铜家峡惨案的“杀人挺进队”的成员。正当欧阳兰陷入痛苦的矛盾中时，坂野正男却带着父亲的嘱托来到太行山，以实际行动表达了他们对当年的愧疚和对中国的友谊。
1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
以朝鲜光海君为了逃避被毒杀的危机，便由与其相貌酷似的平民代替了王的身份为主题，讲述光海君在朝鲜历史上消失的那15天里所未人知的故事。
元朝灭亡后，经过长达十五年征伐兼并，草莽英雄朱元璋（唐国强 饰）终于打败最后一个强劲对手张士诚，在虎踞龙蟠的应天府开创了大明江山的雄伟霸业。这期间刘基、常遇春、徐达等开国将领自然功不可没，而大脚皇后马秀英（吕丽萍 饰）更为朱氏王朝的霸业起到了不可忽视的作用。但是天下初定，乱流湍急，张士诚的女儿、元王朝遗孤、当朝宰相胡惟庸等各方势力和人物时刻威胁着朱元璋的政权和性命。一向大大咧咧、刚愎自用的朱元璋无法及时察觉暗中进行的野心阴谋，好在马皇后心思缜密，从中周旋，化解了无数的危机。 这对吵吵闹闹的夫妻，将携手奠定明王朝的千秋国基……
