该剧是一部犯罪动作搜查剧，讲述一次都没放下过案件的重案组“Outside Black-dog”刑警、满怀热情但苦于收视率不振的调查报导组PD、前职是侧写师的生活型侦探、隐藏过去经营着酒吧的传说的核爆社长、原本是国科搜精英解剖检察官的丧礼指导师，这5个人集合起来痛快且温暖地处理未解决案件的故事。
驿站附近的乐活山庄，暗中收集情报。女掌柜田津津聪明机警，乐于助人，跑堂田大壮武功高强，琴师朴岛毅见多识广。账房田大娘眼力佳记性好。四人各有秘密，却凑到一起。意气风发的福将军因得罪权贵，被贬中枢驿站。但实际上是来中枢城查一件要案。二人日久生情之际，边关急信丢失，送信差役惨死，彻底搅动了城中风云
2002年一个举家团圆的中秋夜晚，肖兰兰、韩彩凤、张晓梅三家人聚集张晓梅自然清新的乡下老家在为五年前同一产房出生的三个孩子过生日。热闹喜庆的生日宴正要开始。在外玩耍的三个孩子，就象人间蒸发一样没了踪影。几个大人从喜悦祥和的气氛里遭受到了巨大打击，顿时陷入了灭顶之灾。孩子的集体失踪，给三个家庭带来了颠覆性的灾难。
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。 由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
