1929年蒋桂战争爆发，军阀势力割据。共产党员覃文邕肩负争取桂系武装力量的任务来到南宁，要争取的对象是义兄章云林，义弟满海子因误会投奔蒋介石。三兄弟因立场和信仰不同，展开了较量。章云林在革命的感召下，揭竿起义，最终为革命献身，战死沙场。满海子经历种种矛盾冲突，了解事实真相，战死沙场。覃文邕的亲密爱人林瑶，经历种种考验，追随覃文邕加入共产党。
1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
以朝鲜光海君为了逃避被毒杀的危机，便由与其相貌酷似的平民代替了王的身份为主题，讲述光海君在朝鲜历史上消失的那15天里所未人知的故事。
人活了几十个年头，到了中年，总是因为生活压力、挫折而抱怨，只会为过去错失的机会而追悔，但这对无梦的人生，俨如一条咸鱼的生活有何用？剧中主角在经历人生低潮时因缘际会下得到改变历史的机会，但历史改写后，人生并没有变得更美好，此令主角明白到，与其懊恼过去，不如把握现在，活在当下。
曾经，陈白露（陈娅安 饰）亦是含着金汤匙出生的千金大小姐，过的是不愁吃穿，随心所欲的自在生活。然而，十二岁那一年，一场意外令陈白露失去了所有，她不得不开始学习如如何用自己的双手，去挣得属于自己的生活。 富家公子陈言（屈楚萧 饰）对陈白露展开了热烈的追求，然而，他的桀骜不驯和挥金如土，在陈白露的眼中不过就是一个不知苦难为何物的大少爷的任性和骄奢。之后，陈言的家庭遭遇婚变，陈言负气出走，失去了家庭的扶持，他变得和当初的陈白露一样无依无靠。直到这时，陈白露才知晓了陈言对自己的情深义重，两人渐渐走到了一起。然而，陈白露的好友海棠（张天爱 饰）亦醉心于陈言，三人被卷入了一段复杂的三角恋情之中。
陈冬晴（陈美琪 饰）无意间目睹了一宗惊人的谋杀案，之后她神秘地消失了。为了找回爱妻并解开谜团，张伟聪（刘松仁 饰）开始了对于案件真相的追查。 最终，冬晴的尸体被找到，张伟聪怀疑她的死与身边的朋友余敏清（关咏荷 饰）、凌梓峰（张国强 饰）以及他的女友楚方怡（吴咏红 饰）有关。张伟聪推理出最可疑的人是方怡，并计划揭露真相，但方怡出于害怕而自杀了。张伟聪认为此事有可疑之处，相信方怡是被人谋杀，而且梓峰是杀害冬晴的凶手。张伟聪与好友吴华生（林保怡 饰）合力调查冬晴和方怡被谋杀的过程，但却没有确凿的证据将梓峰绳之以法。在调查的过程中，张伟聪还揭示出一个更大的阴谋。
动物学家杰克·兰德尔（Jack Randall）前往澳大利亚内陆地区，遇到非凡的野生动物。
