百变校巴和小朋友开心的火星游学之旅继续展开。他们深入探访火星上的不同人造天穹，感受人类利用火星独特的地理环境与自然景观，积极开发和建设火星的创造性成果。他们参观天空天穹，感受作为地球和火星物资中转站的繁忙；来到未来的火星之肺生机天穹，参与拯救小蓝藻，重建生机天穹的任务；深入海洋天穹，探访在海底生活的各种仿生海洋生物。在他们的冒险中，灰灰哥哥引发各种大大小小的危机。这时，百变校巴变身多种形态，迎难而上，化解危机，让小朋友们火星游学之旅充满欢乐与笑声。
东京都高度培养高中，以百分之百的升学率和就业率为自豪，是一个梦幻般的学校，每月发放相当于10万日元的金钱点数。然而，其实际情况是一所实力至上主义的学校，只有少数成绩优秀者才能享受优厚待遇。进入第三学期，从D班晋升到C班的绫小路们前往林间学校。在那里，进行的是被称为“混合合宿”的全年级联合进行的特别考试。正如其名，男女分开，必须组成几个混合多个班级的小组，并以小组为单位进行评分的考试。迄今为止与其他班级的学生作为敌人争斗的他们，必须与他们合作才能获得高分，而且最重要的是，不能达到边缘线的小组将有人退学，这一规定让所有人都感到不安。激动人心的第三学期引起了波澜，现在正式拉开帷幕！
大楚皇帝楚渊18岁登基，硝烟四起，内外皆患，而朝中大臣只想看皇帝最后如何收场。千里之外西南王段白月率军大杀四方，不出半年便平定内乱。外人以为他们是相互敌对的状态，却未料两人在这四面楚歌的战乱中，执手仗剑，共护河山！
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日本幕末时期，在江户长大的少女雪村千鹤出生在一个比较罕见的西医家庭，由于上京工作的父亲已经很久没有联系家里，千鹤怀着对父亲的担心而孤身来到京都，然而她在这里见到的却是正在与嗜血怪物作战的新选组队员们，由于目击到了新选组不为人知的秘密行动，千鹤暂时被软禁起来，从此与新选组结下奇妙的缘份。然而在继续寻找父亲的途中，千鹤遇到了神秘刺客的袭击，当她得知了秘密的全部与自己的身世之后，才发现自己的命运与新选组已经紧紧的联系在一起。（动画版的人物设定可谓美形到了极致，收到众多女粉丝追捧！）
