居于轩辕宫的青云帝无意中惹恼水灵，人间洪水泛滥，青云帝选出人间十二种动物为生肖，救百姓于水火之中。经过重重遴选，鼠、牛、虎、兔、龙、蛇、马、羊、猴、鸡、狗、猪十二种动物荣幸当选为十二生肖，飞升天庭，谁知动物们难守天庭清规，闯下大祸，被玉帝贬下凡间。子鼠以十二生肖之首的身份踏上漫漫长路，在将其他生肖聚集身边的同时，也取得了人类的信任，最后，十二生肖齐心协力，以人类守卫者的身份与洪水猛兽决一死战，青云帝、民间百姓，各路动物纷纷前来相助，最终取得胜利，完成试炼，十二生肖众心合一，回到天庭顺利归位。
日本承办的全球最大体育盛事WSG即将在东京举办开幕式。 为此，融合日本先进技术打造最高时速1000km的「真空超电导磁悬浮」即将通车。往返于新名古屋站至东京新开的芝浜站。 在这个万众瞩目的关头，汇集知名赞助商的酒会现场遇到了突发事件。 知名企业的高官接连遭到绑架。事件背后，是全程监视的赤井秀一，以及等候赤井发令的FBI探员们的身影。 根据柯南的推理，本次事件也许与15年前美国波士顿发生的WSG绑架事件有关，当时也是由FBI管辖。 这真的是偶然吗？在各国游客聚集的日本到底会遇到什么样的事件？ “贯穿日本的子弹”超真空电导磁悬浮启动之时，“危险一家人”终于集结！
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