故事围绕一家名为 “愿望鱼面馆” 的小店展开，核心是六位主角因不同机缘齐聚面馆，三张桌子串联起他们的过往与羁绊，整体风格偏向治愈、温情与悬疑交织。
战乱中两次机智的应变使胡雪岩得到了左宗棠的赏识，他便顺势依附于左宗棠的笔下。胡雪碉一面为左宗棠筹粮，一面利用过手的官银在上海筹办私人钱庄，继尔又独揽替左宗棠代购洋枪洋炮的生意，并为左宗棠计划在福建创建的马尾造船厂筹集资金，后又首举外债。胡雪岩对左宗棠军务的支持引起了慈禧的注意，御封其为四省税务代理总管，后又御赐黄马褂，封为一品顶戴，成为了中国历史上唯一的红顶商人。从此，胡雪岩凭借其卓越的商业头脑，在全国各地设立了“阜康”钱庄分号，在杭州创立了“胡庆余堂”中药店，其事业已如日中天。为了打破洋商的垄断，他还办起了民族工业缫丝厂，迫使贪婪的英商只好求助于历来与左宗棠为政敌的李鸿章。经过李鸿章幕后谋划，胡雪岩被摘去“红顶”，近3000万两银子的家业也顷刻贻尽，一代商业奇才只剩孑然一身。
张大勇（陶大宇 饰）与干探李忠义（梁荣忠 饰）侦察一件件扑簌迷离的案件，很多案件都是案中案，谜团一个接一个，但他们还是能用自己的聪明才智揭露案情的真相，力求把犯罪分子绳之于法。 他们的感情线也是同样曲折迂回：与沙展勇本是青梅竹马情侣的女友容金枝（苏玉华 饰），贪图富贵， 离开了勇却又与忠义有过一段情。 记者高婕（郭可盈 饰）在与阿勇共同查案的过程中擦出了爱的火花，但由于婕本身就有男友，两人的关系进退两难……
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。 由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
官方宣布第三季
