蜀山首席大弟子林长卿惨遭诬陷后被废去修为发配锁妖塔，却意外激活最强悟性系统，从此顿悟各种绝世功法。从练气一层到陆地剑仙，他以一己之力镇压万妖入侵，与狐族圣女胡夭夭和冷艳师姐叶倾城上演了一边斩妖除魔，一边谈恋爱的逆袭传奇。
故事发生在一个名为尤萨尼亚的虚构世界，那里通过一座跃迁门与日本相连。故事围绕两位主角凛（音译，后同）和大地展开，他们离开故土，踏上了寻找心灵归处的旅程。
「思い出して、翅（はね）があったころのことを」 1万2千年前の想いに応え、繋がったのは欠けたこころ。 太陽と月と火星が出会うとき、新たな合体の調べが流れる──！ 湘南の海に浮かぶ小島、江の島。 美しくのどかなその浜辺に、〈私立江ノ島学園〉はある。 学園には、全国から優秀な子どもが集められ、 最新の機器を使った英才教育が施されていた。 特殊強化クラスの生徒〈エレメント〉に選ばれたサッコ、リミヤ、トシは、 感情の力で動く戦闘機〈ベクターマシン〉の操縦を命じられ、 謎の侵略兵器〈神話獣〉との戦いを余儀なくされる。 戦いのさなか、不可思議なヴィジョンに導かれ、サッコは叫ぶ──。 「想星合体！ GO、アクエリオン！」 繰り返される輪廻の果てに、現れた機械天翅アクエリオン。 宿命を背負った少年少女は、 得体のしれない団体〈宇宙たまごの会〉や大人たちの思惑が交錯する中、 この宇宙の真実と向き合っていくことになる……。 これは、おのれの感情と宇宙の存亡を賭けて紡がれる、壮大な愛の神話。
