1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
一队FBI新兵，每个人都有自己特殊的加入理由，他们在弗吉尼亚Quantico努力通过训练。故事在他们过去的隐藏历史和现在的训练之间切换，还将闪现他们不远的将来的片段，其中一个新兵竟然是潜伏的恐怖分子，对911以来美国最大的恐怖袭击负责。
会唱歌但是不会写歌的奥斯汀·穆恩（Austin Moon）与会写歌但是害怕舞台的艾丽·道森（Ally Dawson）不“打”不相识。这对儿非同一般的搭档既要适应舞台上的闪光灯，又要应对普通的高中生活。当然还有他们各自的朋友翠西（Trish）与德兹（Dez）为其出谋划策。这四个好朋友之间又会闹出什么笑话来？
