小咖带领神奇的咖宝伙伴再次出发，一起守护时空。在这一季中，来自宇宙的外星人们带来全新的危机与挑战，它们偷走红色制造城市大乱、吸收海水严重影响生态、抢夺动物危害自然生命，还为了得到黄金而夺走人类的各种资源，甚至还与捣蛋兄妹结盟四处作乱，小咖和咖宝们每一次都果断出击，化解各种危机，他们又回到过去拯救远古生命、维护时空稳定，对付偷猎者、盗窃集团、诈骗分子和黑心商人，以及守护人们、动物们的安全和快乐，时刻保卫身边世界的和平与安宁。
曾经是平凡高中生的深澄真，因为某种缘由被召唤到异世界成为了“勇者”。然而世界的女神却因为「长得太丑了」而立刻剥夺了他的“勇者”称号，发配到了世界尽头的荒野上。在荒野上彷徨的真遇到了龙与蜘蛛、半兽人和矮人族等等非人种族。与原本的世界环境过于不同、不管是在魔法还是战斗中都发挥出超出常识的力量的真，能否通过各种各样的邂逅，在这个世界生活下去……
本田透（堀江由衣 配音）是一名单纯善良的女子高中生。母亲过世后，无处可去的她在误打误撞之中住进了校草草摩由希（久川绫 配音）的家中。草摩由希家里有十二口人，很快，本田透就发现了他们身上的秘密。原来，草摩家族里流传着一个诅咒，那就是他们每个人都对应着十二生肖里的一种动物，另外一个，则是猫妖。 个性冷淡，非常内向的草摩夹（关智一 配音）、幽默风趣的草摩紫吴（置鲇龙太郎 配音）、活泼可爱积极乐观的草摩红叶（斋藤彩夏 配音）、有着复杂过去的草摩波鸟（井上和彦 配音），在知道了这些表面开朗的人们背后隐藏的伤痛后，本田透会怎样给予治愈呢？
故事背景从宏大的江湖庙堂转移到热闹平凡的市井街坊中，沈剑心受掌门李忘生之邀，前往长安城筹建长安纯阳办事处，靠摆摊算卦营业维生。在这“长漂”的日子中，沈剑心不再是拥有主角光环名扬四海的江湖大侠，因为一些对世情的错误认知以及对当下环境的判断不足，导致了一系列稀奇古怪的趣事。就像许许多多个奋斗在大城市的年轻人一样，虽过着喜忧参半的“长漂”日子，但依旧乐观、励志、充满侠义精神。
21世纪，原本能量稳定的人、神、妖三界由于人类社会的飞速发展而失去平衡，神、妖两界紧急启动救世计划，决定派出一批神仙、妖怪来到人界寻找救世方案。苏莫婷是一个带着“神妖之子”身份的社畜女青年，在被父母以“独立自强”为理由请出家门后，遇到了同样流落人间的二货帅气小萌神——天机星以及神秘沉稳酷猫妖——地魁。在土地的主导下，三人结成救世组合，开始上演搞笑而又扎心的无厘头日常。
成为女王的梦想、将来的梦想，都不想放弃！将一生赌在这一瞬间上——高中2年级的夏天，千早所在的歌留多部与新入部员一同在全国大赛中出场。在团体战中击败了常胜校·富士崎高中，瑞泽高中获得期待已久的初次优胜，而个人战中太一和新也获得了B级和A级的优胜。千早在团体战中受伤的右指的手术也顺利结束，和太一一起参加了富士崎高中的夏季合宿。对顾问樱泽老师的斯巴达指导毫不在意，以名人·女王战为目标努力练习，但就在此时，他们得知了让出场变得危险的某个事实……另一方面，新了解到拥有团队可以扩展歌留多的可能性，于是他开始准备创立歌留多部.新的对手登场，今后的出路，成为女王的梦想……纯正的高中生一心一意的心念和热情满溢而出的第3期开幕！
