天宝十二年，不谙世事的英俊少年孔鸿俊，肩负三项重任离开太行山上的曜金宫，来到歌舞升平、锦绣繁华的长安。孔鸿俊初入大唐驱魔司，顶头上司竟是不久前交过手的龙武军将领李景珑。而他竟然失手将陈氏心灯打碎，心灯进入了李景珑的体内。在那盏灯的光影里，有平康里的灯红酒绿、驱魔司夏日阳光下的梧桐、茫茫塞外的漫天风沙与飞雪、阿泰如清泉般的歌声、莫日根与陆许摘下的清晨树叶、裘永思飞扬的笔锋。
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」，被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。 在社会获得显著发展的背后，恐怖的怪物出现了。 吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。
日本幕末时期，在江户长大的少女雪村千鹤出生在一个比较罕见的西医家庭，由于上京工作的父亲已经很久没有联系家里，千鹤怀着对父亲的担心而孤身来到京都，然而她在这里见到的却是正在与嗜血怪物作战的新选组队员们，由于目击到了新选组不为人知的秘密行动，千鹤暂时被软禁起来，从此与新选组结下奇妙的缘份。然而在继续寻找父亲的途中，千鹤遇到了神秘刺客的袭击，当她得知了秘密的全部与自己的身世之后，才发现自己的命运与新选组已经紧紧的联系在一起。（动画版的人物设定可谓美形到了极致，收到众多女粉丝追捧！）
