该剧以位于地方城市的石垣医院为背景，讲述怪胎天才医生金师傅和热情高涨的年轻医生们之间的故事。由第一季的刘仁植导演、姜银庆编剧再次合作。
艾米尔（安以轩 饰）是自小含着金汤匙出生的千金大小姐，肩上背负着支撑家族企业运作的重任。父亲将她许配给了隆科集团董事长的儿子何一坤（侯京健 饰），可是何一坤已经有了深爱的女人夏青青，而艾米尔亦焦急的寻找着下落不明的男友王特（王钧赫 饰）的踪迹。 离家出走的艾米尔在误打误撞之中邂逅了名为何开心（朱一龙 饰）的心理咨询师，巧合的是，何开心竟然是何一坤同父异母的弟弟。最终，艾米尔得知王特为了利益将自己抛弃，痛苦和绝望之中，她回到家里同意了这场商业联姻。然而，最终走入婚礼殿堂的，却是夏青青，原来艾米尔为了成全何一坤，不惜牺牲了自己的利益。
该剧讲述了“程浩”和“陆鸿渐”双男主在平行空间互换身份，与迷妹林小小所发生的故事。
第三季的故事从“高第街工业品市场”铭牌挂上高第街牌坊开始，街坊们有的早餐店越做越火，有的从事服装生意，有的专卖进口产品，有的开音乐茶室，有的组建乐队，有的赴港探亲……在充满激情的年代，高第街街坊们跟着时代的步伐，每个人都找到自己的新生活。
燕璃国，大将军府的柳静姝和柳嘉是一对双胞胎姐妹。当时，双生子被视为不祥之兆，妹妹柳嘉便从小隐藏身份，以二狗的名字被柳大将军偷偷养在府中。长大后的两人虽长相如出一辙，但性格截然不同，姐姐温柔大方，妹妹却活泼调皮，且经常冒充姐姐的身份溜出府邸，玩闹惹事。二姐妹十五岁时，在将军府和宣平侯府联姻的订婚宴会上，萧任衍因不愿轻易接受被安排的婚姻，还未入席就找理由离开，没想到好遇到来厨房偷东西吃的柳嘉。二人误打误撞，落入水中，在水下却不小心吻在了一起。柳嘉真面目被看到，萧任衍却对柳嘉动了心。柳将军经过反思，觉得柳嘉一直被藏着也对她不公平，便在战争开始后，把她带到边疆抚养。 三年后，在边疆长大的柳嘉洒脱恣意，武艺高强，但也善良直爽……
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。 由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
故事开始于八百年前，柯天仁（杨庆煌 饰）虽然拥有一颗善良的内心，却因为其丑陋的外貌而饱受周遭人的欺侮。只有千金小姐白玉莲（况明洁 饰）不嫌弃柯天仁的外貌，不仅如此，她还三番五次的帮助柯天仁渡过难关。随着时间的推移，两人之间产生了真挚的感情，然而，这段感情注定不会有结果，在家人的强烈反对和棒打鸳鸯之下，柯天仁和白玉莲忍痛分手，并相约来世再续前缘。 就这样一晃数百年过去，柯天仁投胎转世成为了玉琳和尚，而白玉莲则化身成为顺亲王府的珍格格。一场意外的邂逅让珍格格想起了两人前世未尽的姻缘，可是玉琳和尚早就把身心全部奉献给了佛祖。
