《倩女奇冤》的4个单元风格各异，分别是悲剧、功夫剧、轻松幽默剧、生死爱情剧。《新窦娥冤传奇》为人性大悲剧，令人悲中生怜，发人深思；《新谢小娥复仇传奇》为精彩功夫剧，使人在善恶爱恨中杀得难解难分，功夫又精彩了得；《新英娘救父传奇》为轻松幽默剧，小英娘金銮殿斗皇帝，惊险中妙趣横生；《新陈三两爬堂传奇》为生死爱情剧，于虎狼窝中守身如玉、爱恨分明。
邪派魔头宣慈一心想夺取天师府的至宝，率领手下进攻天师府，导致张天师受伤后逃离。宣慈派出三大杀手追击张天师。林楚燕是地方官林浩然的独生女，她从奶妈胡大婶那里学得一些小法术，能够在酒后施展阴阳眼，察觉到鬼魅的存在。林浩然是文官，而司徒镇业则是武官，两人相互勾结以敛财，为了避免猜忌，他们决定撮合他们的子女成婚。林楚燕对司徒文武有着深厚的感情，两人最终结为夫妻。然而，命运捉弄人，他们的成婚之夜楚燕因误饮交杯酒，看见了不应该看到的事物，导致误伤了婆婆，最终被休去妻子的地位。 尽管楚燕私下暗恋丈夫，她尽管生性高傲，内心却充满不甘，仍然不顾万里艰辛，寻找文武，希望能够挽回他的心。张天师发现司徒文武是七星脚，是修道的奇才，便收他为徒。张天师了解到楚燕的心思，决定帮助他们重新走到一起。在一个小镇上，文武遇见了戏班花旦凝凤，对她一见倾心。然而，戏班中的文生金玉棠也对凝凤展开了追求，却无意中发现她实际上是魔教的杀手人凤，并最终被杀害灭口。人凤对文武动了真情，但却因宣慈的命令要杀死文武，幸好张天师和楚燕及时赶到，最终人凤被张天师所杀。尽管遭遇重重困难，文武依然执迷不悟，愤然离去。
1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
Gibbs和他的调查组着手调查一起牵连海军罪案调查处特别探员NickTorres（新常规演员WilmerValderrama）的汽车爆炸案——Nick六个月前在阿根廷执行深度卧底任务时神秘失踪。Gibbs接连拒绝了八名填补DiNozzo职位空缺的人选……其实他早就看上了海军罪案调查处特别探员AlexQuinn（JenniferEsposito），非她不要！DuaneHenry扮演的军情六处特工ClaytonReeves从本季开始成为常规角色。
