精灵宝可梦，简称宝可梦， 这颗星球上非常非常不可思议的生物， 在天空、大海、森林、街道之中到处都能看到它们的身影。 持有不可思议吊坠的来自帕底亚的少女——莉可。 持有神秘精灵球的来自关都的少年——罗伊。 以广阔的宝可梦世界为舞台， 莉可和罗伊的新冒险开始了！ 等待两人的相遇，还有命运是—！？ 这是一个通过冒险“找到”重要的东西的故事。
麦克·麦克和奥斯卡从他们不可思议的冒险中归来已经一年了。现在，秃鹫在美国总统选举中破坏了将灰熊幼崽交给对手的邪恶计划后，麦克麦克、奥斯卡、熊猫少年和鹳开始了另一场伟大的冒险，他们乘坐齐柏林飞艇将小灰熊...
青虫怪利用监视蔬菜精灵的办法偷窥到了很多蔬菜精灵们的秘密，在得意之下他大肆宣扬，放了个大喇叭对着蔬菜园，循环播放自己观察到的秘密嘲笑蔬菜精灵们，蔬菜精灵们很生气，觉得自己的隐私被侵犯了，大家决定主动出击去找青虫怪算账。没过几天，蔬菜精灵们造出了一个空中播放器，他们要以欺人之道还治欺人之身，收集了青虫怪的癖好和隐私在空中播放，而且还会随着导航向其它的青虫居住地飞行，让青虫怪也尝尝隐私被人侵犯的滋味。青虫怪即恼怒又无可奈何，只好躲在贪吃府不出门，蔬菜园又可以维持一段时间的平静了。
故事发生在一个名为尤萨尼亚的虚构世界，那里通过一座跃迁门与日本相连。故事围绕两位主角凛（音译，后同）和大地展开，他们离开故土，踏上了寻找心灵归处的旅程。
