地处新香港市的一个喧嚣夜晚，一度沉缅立体格斗的美剑阳菜(池泽春菜 配音）和夏树、惠美正在巨蛋体育馆观看精彩纷呈的异种格斗，突然之间体育馆内出现剧烈爆炸。阳菜从短暂的昏迷中醒来，发现自己被号称GOMA四天王之一的真红之莎菲亚摄入一个异度空间。危急时刻，冷静沉着的仙蒂·撒哈尼（桑岛法子 配音）出面拯救了她。连番激战过后，阳菜体内蕴含的力量觉醒，实现变身。随后，凤丽华（木村亜希子 配音）也加入战斗中。另一方面，阳菜的父亲随某考古学家探究远古文明的秘密，无意中启动了古文明的动力装置。世界开始面临前所未有的改变…… 本片根据大张正己和青树零梦的原作改编。
故事背景从宏大的江湖庙堂转移到热闹平凡的市井街坊中，沈剑心受掌门李忘生之邀，前往长安城筹建长安纯阳办事处，靠摆摊算卦营业维生。在这“长漂”的日子中，沈剑心不再是拥有主角光环名扬四海的江湖大侠，因为一些对世情的错误认知以及对当下环境的判断不足，导致了一系列稀奇古怪的趣事。就像许许多多个奋斗在大城市的年轻人一样，虽过着喜忧参半的“长漂”日子，但依旧乐观、励志、充满侠义精神。
「思い出して、翅（はね）があったころのことを」 1万2千年前の想いに応え、繋がったのは欠けたこころ。 太陽と月と火星が出会うとき、新たな合体の調べが流れる──！ 湘南の海に浮かぶ小島、江の島。 美しくのどかなその浜辺に、〈私立江ノ島学園〉はある。 学園には、全国から優秀な子どもが集められ、 最新の機器を使った英才教育が施されていた。 特殊強化クラスの生徒〈エレメント〉に選ばれたサッコ、リミヤ、トシは、 感情の力で動く戦闘機〈ベクターマシン〉の操縦を命じられ、 謎の侵略兵器〈神話獣〉との戦いを余儀なくされる。 戦いのさなか、不可思議なヴィジョンに導かれ、サッコは叫ぶ──。 「想星合体！ GO、アクエリオン！」 繰り返される輪廻の果てに、現れた機械天翅アクエリオン。 宿命を背負った少年少女は、 得体のしれない団体〈宇宙たまごの会〉や大人たちの思惑が交錯する中、 この宇宙の真実と向き合っていくことになる……。 これは、おのれの感情と宇宙の存亡を賭けて紡がれる、壮大な愛の神話。
