玛丽（贝热尼丝·贝乔BéréniceBejo饰）和鲍里斯（塞德里克·康CédricKahn饰）结婚已经十五年之久了，在这漫长的岁月中，无数的争吵将两人对彼此的感情最终消磨殆尽，这场婚姻走到...
1999年，某个东西被卡车运出了馆山市。几天后，哥斯拉登陆了馆山，特生自卫队出动与之展开了苦战。在战斗中，自卫队员家城茜（釈由美子 饰）意外害死了战友叶山二尉（森末慎二 饰），自己却侥幸活了下来，并被派去了资料科。 另一方面，日本政府在柘植真智子首相（水野久美 饰）的指挥下，召集了汤原德光（宅麻伸 饰）等科学家开始研究对付哥斯拉的G兵器。他们以在馆山冲挖掘出来的初代哥斯拉骨骼为基础，用了四年制成了机械哥斯拉——3式机龙。柘植首相辞职，由科学技术厅长官五十岚隼人（中尾彬 饰）就任新首相。同时，茜被派去了机龙队，担任机龙的操作员。 就在准备机龙测试机动时，哥斯拉又在东京湾出现了。机龙赶赴现场与哥斯拉对战，却因哥斯拉的吼声唤醒了体内的野兽灵魂，突然暴走，在城市中造成了大破坏。 为了改良机龙，汤原改变了机龙DNA计算机的碱构造，使机龙不会再受哥斯拉叫声的干扰。但由于对再次暴走的担忧，五十岚迟迟不允许出动机龙。 哥斯拉再度出现在东京湾，一路无视特生自卫队的攻击来到了品川，令城市变成了一片火海。面对如此情景，五十岚终于同意让机龙出动。 为了打败哥斯拉，机龙被送到了品川。茜也抱着必死的觉悟。机龙和茜的战斗就这样开始了。
年轻的露西（丽芙·泰勒LivTyler饰）带着她母亲自杀后留下的日记，来到了一个小镇上探访母亲往昔的好友，并住在雕塑家格雷森的家中。其实四年前，露西就和母亲来过这里，还认识了一个叫尼古拉的男孩。...
丹尼（瑞斯·伊凡斯 Rhys Ifans 饰）和女友特鲁迪（贾丝婷·克拉克 Justine Clarke 饰）交往多年，后者对他的感情早已经由浓转淡，时常在不知不觉之中对他流露出轻蔑的意思，这让丹尼感到十分沮丧。一天，丹尼在自己坐的椅子上绑满了气球，想不到竟然飞上了天空，丹尼在天空中飘啊飘，不知道飘了多久，在一场盛大的烟火表演中终于重回地面。 丹尼降落在了一个名为克拉伦斯的小镇上，在那里，他邂逅了名为格伦达（米兰达·奥图 Miranda Otto 饰）的姑娘。善良热情的格伦达渐渐吸引了丹尼，也重塑了他的自信心，就在两人浓情蜜意之时，特鲁迪来到了他的身边。
芝加哥大学毕业的物理学家鲍里斯（拉里•戴维 Larry David 饰）自认天才，对世界及人性均极度悲观，在莫名其妙与妻子分手后跳楼自杀未遂，辞去工作搬到纽约曼哈顿城中，靠教小孩象棋为生。某晚在家门口发现了从密西西比州离家出走的天真少女美乐蒂（埃文•雷切尔•伍德 Evan Rachel Wood 饰）。美乐蒂请求鲍里斯收留，极不情愿的鲍里斯只答应让她暂住一晚，却没想到美乐蒂不仅对他的天才极度尊敬，在同龄朋友面前大加赞扬，并对自己渐生爱意。尽管有着四十多岁的年龄差异，二人仍决定结婚。不久美乐蒂的母亲玛丽埃塔（帕特里西娅•克拉克森 Patricia Clarkson 饰）被丈夫抛弃后从密西西比来访，与鲍里斯的朋友凯文（亚当•布鲁克斯 Adam Brooks 饰）一见钟情。凯文帮助玛丽埃塔成为了摄影师，但对鲍里斯不满的玛丽埃塔却想尽办法拆散他与美乐蒂……
