世青篇故事环绕日本队在大空翼带领下参加世青杯。本篇有两个序幕，分别介绍了两个新角色“太阳王子”葵新伍和“神之子”山达拿的出场。而大空翼已经成为了巴西职业足球队圣保罗的10号球员。“神之子”山达拿的经典金句为:“我故意不让守门员碰到足球，以免弄断他的手腕。”(出现于第一期)故事早段描述日本队进军世青杯决赛周的过程，由于日向、岬、政夫、和夫、次藤、早田、新田七个主力球员被逐出球队，日本青年军仅余下翼、三杉、守中卫、佐野及石崎等球员可用，晋级过程艰辛，其中对泰国一役更有翼中途伤出，幸好源三及新伍及时加入，令日本青年军顺利以外围赛冠军身份晋身决赛周。晋身决赛周的日本队虽然有多名主力实力得以提升并归队，但中场球员岬却遇上车祸未能参赛。及后日本队在大空翼、日向及松山等球员坐镇下、再加上新伍及赤井等新加入球员的出色表现，先后击退空中战强队墨西哥、攻击力极强的乌拉圭、伤兵累累的意大利、欧洲劲旅瑞典及荷兰，杀入决赛，对手是从未交手的巴西。在对巴西一役，岬于下半场带伤复出，而比赛尾段出场的巴西队10号后备球员拿度尼更成为了大空翼的最强对手。最后日本于加时击败巴西成功夺得世青杯冠军。

战国时代著名人物之间的战争风云。由于漫长的战乱，室町幕府日渐式微世界进入了崇尚血债血偿的战国时代山海秘境，纪之国这片茂密的森林深处，有一个以八咫乌为军旗纹章的枪炮集团。他们以佣兵为业，驰骋沙场，其名为“杂贺众”。继承杂贺众首领名号的人名为孙一，是一名从异国漂流至此的青年。而另一边，最早察觉欧洲列强侵略意图的三郎，则为了守护日本而四处奔走。原本毫无交集的两人随着异国侵略者的袭击而产生了联系。这群身处战国时代的男人会如何贯彻自己的信念与正义。

故事发生在二十一世纪末，彼时，魔法早就已经不再仅存与神话和传说之中，而是同科学与超能力融合，成为了人尽皆知的存在。国家甚至成立了魔法大学附属第一高校，专门培养此方面的人才，以便更好的为国家效力。司波达也（中村悠一配音）和妹妹司波深雪（早见沙织配音）是魔法高校的新生，深雪是能力优秀的“花冠”，而达也则是作为其替补的二科生“杂草”。在学园中，兄妹两人结识了许多有趣的同伴们——个性大大咧咧不拘小节的千叶艾丽卡（内山夕实配音）、文静胆小的柴田美月（佐藤聪美配音）、正直勇敢的西城雷欧哈鲁特（寺岛拓笃配音）、认真努力的吉田干比古（田丸笃志配音），在学习的过程中，存在于学园之中的秘密也在逐渐揭晓。

故事发生在私立汐美学园之中，这里汇聚着在各种方面有着杰出表现的孩子们，他们的身上，承载着整个城市的荣耀和希望。学园之中有着“睿智之城”美名的图书馆格外醒目，然而，在图书馆最深处的阅览室中，大幕正在徐徐的拉开。有着旺盛求知欲的笕京太郎（间岛淳司配音）、乐观开朗积极努力的白崎绪美（米泽圆配音）、稳重认真深受信赖的樱庭玉藻（齐藤佑圭配音）、外冷内热的御园千莉（山本希望配音）、温柔善良的铃木佳奈（仙台绘里配音）和大大咧咧的小太刀凪（种崎敦美配音），六名互不相识的少年少女在冥冥之中汇聚在此处，即将展开他们波澜壮阔的冒险。

当艾伦释放出巨人的终极力量时，世界的命运岌岌可危。怀着消灭所有威胁艾尔迪亚的人的强烈决心，他率领一支不可阻挡的巨人大军向马莱进击。