大明洪武年间，丁武和蒋瑍是锦衣卫内一对亲如兄弟的小旗官，一个家有怀孕的老婆，困于茶米油盐；一个爱上了青楼女子，在平凡的职场中等一个上位的机会。两人奉命调查一桩连环杀人谜案，牵出一起重大贪腐案，紧要关头...
大宋淳祐七年，钦州灵龙镇灾患频现，民间谣言乃蛟龙作祟，需将童男童女投入锁龙井喂食蛟龙方能得享安宁。祭祀恶俗持续多时，不知多少无辜孩童葬身龙腹，灵龙镇哭声震天，家有幼童者皆人心惶惶。新科进士庄严担任主簿后，坚持进入锁龙井调查蛟龙事件，却不想竟因得罪龙王而锒铛入狱。灵龙县仵作小宛为救心上人，不远千里求请已金盆洗手的宋慈出山查明真相。案件疑点重重，宋慈和小宛联手突破重重难关，终于赶在庄严被斩之前查明真相，庄严得以平反，小宛也在众人的见证下正式向宋慈拜师学艺。然而眼看灵龙镇逐渐恢复平静，宋慈却发现原来真相并没有他想象中那么简单。
少年宋慈游学中，路遇少女被害案，因为经验不足险些误判，幸好遇奇人用红油纸伞找到线索。宋慈感慨自己学识不足，苦苦追寻亲人，大破米囊花镇掳人案，成就一段传奇。
前朝太后一世追求长生之术，后留《十二长生赋》传说于世引各方争抢。民国年间，黄庙村中李老爷一生行善却暴毙家中，头七之日，枯井生水怨鬼还魂，坊间传言其为长生之术反噬。为查真相，民间异士林道长行奇门遁甲之术...
