该剧是一部犯罪动作搜查剧，讲述一次都没放下过案件的重案组“Outside Black-dog”刑警、满怀热情但苦于收视率不振的调查报导组PD、前职是侧写师的生活型侦探、隐藏过去经营着酒吧的传说的核爆社长、原本是国科搜精英解剖检察官的丧礼指导师，这5个人集合起来痛快且温暖地处理未解决案件的故事。
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。 由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
在第三季中，团队与一个偷取人们地下清洁水源并将其变为肮脏金钱的权力掮客展开对抗，与一个在小镇中既是法官又是陪审团的市长斗智斗勇，设法躲避一个在骗局中半路追上他们的目标，智斗一个兼营国际敲诈的台球高手，并揭露一个剥削童工的工业家。与此同时，他们还得应对来自过去敌人的精密复仇计划，以及处理新的人际关系所带来的后果。但无论面对什么挑战，只要有人需要帮助，他们总会提供……“天赐之力”。
故事发生在美丽的西南边陲。由罪恶、阴谋、美色、金钱和暴力编织的黑色网络一次又一次被年轻的边防缉毒战士撕毁。即使是曙光初照的黎明，为人类健康和尊严而战的硝烟仍远未散尽…… 高松是南疆边防支队调研参谋，朱镇疆是边防支队副支队长。在一次临时决定的紧急抓捕行动中，由于准备不充分，使境内头号毒枭马远从暗道逃脱，而且有两名战友在战斗中牺牲。高松因此受到上级调查局的怀疑，心理压力很大。情同兄长的朱镇疆毅然为高松承担了全部责任。 朱镇疆平静地脱下军装，转业到了地方的计生委。壮志未酬的朱镇疆感到分外失落，但他极力掩盖着，俨然以一位永不服输的硬汉姿态配合总队继续他一生为之奋斗的缉毒事业。 高松和吕跃既是战友又是情敌。两个男人如何面对情场战场的两难选择？方红原来以为高松会为了她改变自己，没想到职业在高松心里是第一位的，她很失望。 马远出境后投靠了地方军阀勐哈拉，他认为朱镇疆转业对自己开展业务很有利，因为朱镇疆对贩毒缉毒太熟悉了。 总队通报目前贩毒活动猖獗，内地查获几起特大贩毒案，毒品都是从云南入境的。毒贩作案手段扑朔迷离，支队每每在关键时刻失手。虽然侦破了几次马远策划的贩毒活动，但并未能摸到马远集团的核心。 风情万种的郭春主动投入高松的怀抱，却原来是为能争得报十年前杀父之仇的点点机会。朱镇疆的种种行为更令高松深感震惊，难以相信。他日渐消沉，喝酒赌博，终于被勒令转业。由此引出了真假莫辨的连环卧底，刀光剑影中英雄气短，儿女情长。 经过痛苦的选择，忠诚战胜了感情。高松借卧底身份，找到毒枭接头的地点。当高松终于一步步逼近事实真相，又一步步陷入险境时，朱镇疆以死结束了他挑战人性的使命，也结束了他给徒弟高松的最后一课。
